home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9408a.zip / M9480157.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-09  |  2KB  |  30 lines
  1.        Document 0157
  2.  DOCN  M9480157
  3.  TI    Automat: a novel software system for the systematic search for protein
  4.        (or DNA) similarities with a notable application to autoimmune diseases
  5.        and AIDS.
  6.  DT    9410
  7.  AU    Cantalloube H; Nahum C; Achour A; Lehner T; Callebaut I; Burny A;
  8.        Bizzini B; Mornon JP; Zagury D; Zagury JF; Universite P. et M. Curie,
  9.        Paris, France.
  10.  SO    Comput Appl Biosci. 1994 Apr;10(2):153-61. Unique Identifier : AIDSLINE
  11.        MED/94290911
  12.  AB    Automat is a novel program which finds exhaustively all the oligopeptide
  13.        segments shared by a given protein of any size with the proteins of a
  14.        whole databank. It allows the user to collect statistics on the
  15.        composition of the sequence studied in reference to the databank used.
  16.        We present here the rationale and the algorithm underlying this powerful
  17.        software. Besides its immediate interest for identifying efficiently
  18.        similarities between proteins (or DNAs), biological applications of this
  19.        software have already been described in the case of HIV-1 viral
  20.        proteins, and Automat should prove useful also for studying more
  21.        generally autoimmune diseases.
  22.  DE    Acquired Immunodeficiency Syndrome/*GENETICS  Algorithms  Amino Acid
  23.        Sequence  Autoimmune Diseases/*GENETICS  Human  HIV/*CHEMISTRY
  24.        Molecular Sequence Data  *Sequence Alignment  Sequence Analysis, DNA
  25.        *Software  Support, Non-U.S. Gov't  JOURNAL ARTICLE
  26.  
  27.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  28.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  29.  
  30.